Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CROTQ9UKG9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CROTQ9UKG9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms