Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN4Q9UJW0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCTN4Q9UJW0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN4Q9UJW0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms