Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MID2Q9UJV3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MID2Q9UJV3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms