Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU2

LEF1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEF1Q9UJU2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LEF1Q9UJU2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
LEF1Q9UJU2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LEF1Q9UJU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms