Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA1Q9UIW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA1Q9UIW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms