Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPN3Q9UHW5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPN3Q9UHW5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPN3Q9UHW5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms