Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP25Q9UHP3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP25Q9UHP3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP25Q9UHP3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms