Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTNAP2Q9UHC6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTNAP2Q9UHC6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms