Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN2A-AS1Q9UH64 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms