Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3BQ9UH17 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3BQ9UH17 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms