Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM8A1Q9UBU6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms