Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTTNBP2NLQ9P2B4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms