Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP36Q9P275 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP36Q9P275 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP36Q9P275 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms