Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCHIP1Q9P0W5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCHIP1Q9P0W5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms