Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2AFY2Q9P0M6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2AFY2Q9P0M6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2AFY2Q9P0M6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2AFY2Q9P0M6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2AFY2Q9P0M6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2AFY2Q9P0M6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
H2AFY2Q9P0M6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms