Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPG21Q9NZD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPG21Q9NZD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPG21Q9NZD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms