Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ08

ERAP1, Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERAP1Q9NZ08 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ERAP1Q9NZ08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERAP1Q9NZ08 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms