Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP39A1Q9NYL5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP39A1Q9NYL5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP39A1Q9NYL5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP39A1Q9NYL5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP39A1Q9NYL5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYP39A1Q9NYL5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CYP39A1Q9NYL5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYP39A1Q9NYL5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms