Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM53CQ9NYF3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM53CQ9NYF3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM53CQ9NYF3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms