Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBA8Q9NY65 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBA8Q9NY65 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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