Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SMPD4Q9NXE4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD4Q9NXE4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms