Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNHIT6Q9NWK9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT6Q9NWK9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms