Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXD2Q9NVH0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXD2Q9NVH0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms