Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC38A7Q9NVC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC38A7Q9NVC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC38A7Q9NVC3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms