Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOPORSQ9NS56 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOPORSQ9NS56 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOPORSQ9NS56 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms