Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSS2Q9NR19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSS2Q9NR19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms