Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2CQ9NQX7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2CQ9NQX7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms