Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB3Q9NQW8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNGB3Q9NQW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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