Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQU5

PAK6, Serine/threonine-protein kinase PAK 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK6Q9NQU5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK6Q9NQU5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK6Q9NQU5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK6Q9NQU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK6Q9NQU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK6Q9NQU5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK6Q9NQU5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK6Q9NQU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAK6Q9NQU5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAK6Q9NQU5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAK6Q9NQU5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms