Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCUBE2Q9NQ36 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms