Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRIP3Q9NQ35 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NRIP3Q9NQ35 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms