Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRD7Q9NPI1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRD7Q9NPI1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
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