Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MID1IP1Q9NPA3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms