Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PNPLA8Q9NP80 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PNPLA8Q9NP80 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNPLA8Q9NP80 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms