Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRMS1Q9HCU9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms