Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XAB2Q9HCS7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XAB2Q9HCS7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XAB2Q9HCS7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms