Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CENPJQ9HC77 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CENPJQ9HC77 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CENPJQ9HC77 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms