Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCAS3Q9H6U6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BCAS3Q9H6U6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BCAS3Q9H6U6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms