Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RNF41Q9H4P4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNF41Q9H4P4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms