Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNMDQ9H2S6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNMDQ9H2S6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNMDQ9H2S6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms