Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH9Q9H1X1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH9Q9H1X1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH9Q9H1X1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH9Q9H1X1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH9Q9H1X1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH9Q9H1X1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH9Q9H1X1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RSPH9Q9H1X1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RSPH9Q9H1X1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RSPH9Q9H1X1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms