Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1U4

MEGF9, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF9Q9H1U4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MEGF9Q9H1U4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MEGF9Q9H1U4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms