Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG10Q9H0Y0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG10Q9H0Y0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms