Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIK2Q9H0K1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIK2Q9H0K1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms