Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD1Q9GZZ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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HOXD1Q9GZZ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD1Q9GZZ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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