Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INO80BQ9C086 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms