Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TM6SF1Q9BZW5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TM6SF1Q9BZW5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms