Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM8Q9BZR9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM8Q9BZR9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM8Q9BZR9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms