Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF7Q9BWX1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF7Q9BWX1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms