Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1orf43Q9BWL3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms